日前總統賴清德定調中共為境外敵對勢力，區桂芝隨後獲邀到《央視》受訪，她稱自己在中國有親人，賴的說法要她如何面對中國的親人，怒轟賴狠心、良心何在，更提到台灣是中國的，若台灣不認中國的話將無法面對祖先。
此番言論在台灣引發熱議，更有民眾為此提出檢舉，指控她違反教育中立，台北市教育局接獲陳情後向學校要求了解，北一女校長陳智源也為此約談區桂芝。事後教育局表示，沒有學生反映老師在課堂上違反教育中立，區也沒有在校內違反教育中立的情事，教育局尊重教師的專業自主權和言論自由。
區桂芝的兩岸發言屢屢登上新聞版面，引發正反雙方意見隔空交火，北一女3月31日發出一份公告表示，「本校校風自由民主，在不違反法律規定的前提下，包容多元意見並尊重不同立場」，然而考量到目前兩岸政治的關係緊張，「為避免行生不必要的困擾，即日起，禁止本校教職員工接受中華人民共和國所屬官方媒體採訪（例如央視）」。
此外，校長陳智源也提到，為避免個人言論引起社會輿論熱議或造成誤會，「即日起，本人暫停社群網站發文並謝絕所有媒體採訪。」
《聯合新聞網》報導，該份聲明只給北一女內部教職員工和學生，教育局已證實此事；區桂芝則表示理解學校的決定，她尊重、也遵守，認為校長也有他的壓力，不想造成他的困擾。
