中選會說明，經與南投縣選委會及各戶政事務所逐筆查核後確認，戶政資訊系統並無建置民眾簽名樣式資料庫，戶政機關亦未以筆跡進行比對，相關疑慮為誤解。同時強調選務機關並未使用戶政資訊系統查對連署簽名。
根據中選會複查結果顯示，南投第1選區立委馬文君罷免案原報不合規定人數為3,817人，修正後為3,618人，符合人數為17,091人，距法定門檻尚差1,531人；第2選區立委游顥罷免案原報刪除4,020人，修正為3,512人，符合人數19,648人，仍差185人。
中選會表示，針對南投兩起罷免案，南投地檢署已分案偵辦，無論是中選會、南投縣選委會或協助查對的戶政機關，均將依法配合司法單位調查。目前馬文君與游顥罷免案第二階段補提連署名冊的期限，同樣是6月3日與6月5日，時程不變。
