在擔任台中市刑大隊長期間貪污罪被收押，去年因病交保。台中地院近期密集開庭，擬本月22日傳林出庭，林病情惡化無法出庭，林的律師日前向法院請假外，並提出醫院診斷書聲請停止審判。法官審閱期病例後，認為林雖行動不便、無法下床，但意識清晰，仍能接受訊問，因此仍維持開庭，但改採視訊。令至於停止審判的部分，法官尚未最作出裁定。
林明佐被控為博弈集團「內鬼」，在擔任台中市刑大隊長期間，涉嫌洩漏偵查機密，並收受博弈業者高檔洋酒，另有高達6,616萬餘元財產來源不明財。林被羈押看守所二進二出：2024年5月3日第一次收押禁見；2025年3月18日首次獲准1,200萬元交保。2025年4月14日檢方抗告成功，重回羈押。
2025年6月11日 因「惡性脊髓腫瘤」病危，法院准予1,500萬元再交保，限制住居、出境、出海8個月，並應遵守每週向指定警局報到、電子科技監控等規定。林明佐罹患的是腰間椎脊髓內許旺氏細胞瘤，需仰賴輪椅、大小便失禁，多次從限制住居的屏東住處送往高雄義大醫院急救，醫院也曾發出病危通知。
