因三中案入獄的前國民黨立委蔡正元，過去公開質疑沈伯洋可能是美國中情局（CIA）間諜、特務，國民黨立委傅崐萁也跟進在議會殿堂喊沈間諜，不過沈伯洋多次澄清，在學界與非政府組織（NGO）等單位，申請各國機構、基金會等補助進行研究皆為常態，日前上《少康戰情室》節目專訪時，主持人趙少康也再提舊話，沈伯洋除了當面否認外，還特別澄清前立委陳柏惟說他「右手拿CIA資金、左手拿中共錢」，只是戲謔外界誤解的玩笑話。
聰明外星人來幫助人類？
彭文正線上專訪唐新民昨（11日）播出，其中唐新民轉述宣稱「沈伯洋是外星人，很聰明的外星人，來地球幫助人類」，還稱民進黨立委林俊憲已經開始為這件事進行消毒，還要彭文正自己去查一下，並斷言「沈伯洋是蜥蜴人、不是人類」，甚至還說因染色體問題無法生育，所以沈家族四代皆領養。
沈伯洋如何看待奇異言論？
唐新民另也提到一個新奇論點，指沈伯洋為全球兄弟會組織「共濟會」推派來「執行毀滅台灣」，還說沈的名字是共濟會所取，可拆解為「沉人白羊沈伯洋」，把人類當成兩腳羊，「非常狠，把你們成人白人刷羊肉」，彭文正還搭話驚呼：「那我們就變成了蒜泥白肉？」種種奇異言論畫面在社群瘋轉，也釣出沈伯洋親自回覆：「我已經從CIA變成外星人了嗎？」
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