親民黨立委陳怡潔質詢時針對兩岸議題詢問賴清德態度，賴除強調台灣是主權獨立國家外，並表示，兩岸交流原則，就是在互助互惠、善意不變、承諾不變，也不在壓力下屈服等原則推動工作。
賴清德說，兩岸有共同目標，也有共同敵人，應該共同合作。他特別解釋，兩岸面臨的共同敵人就是會面臨颱風、地震、愛滋病與傳染病等課題，雙方應為兩岸共同福祉努力，「北京當局如果瞭解這一點，相信很多問題都可以解決！」
陳怡潔追問，因賴清德過去主張台獨，所以上任後對岸國台辦對賴並無期待，有何看法？賴清德再次強調，台灣是主權獨立國家，目標是追求人民的最高福祉，「不用在強權所畫的圈子裡面打轉，也不用在乎有些人說的一些話。」
隨後，時代力量立委林昶佐質詢時針對兩岸交流主管機關定位提問。賴清德表示，兩岸關係應在「國際關係」的脈絡下進行，「我們希望用外交部，但對方不會接受，所以陸委會還是有存在必要。」
