本刊調查，行政院研擬以公共建設計畫編列15億元，正式由政府接手自建，預計2019年動工，完工後再與目前營運的主題館一起委外營運，這套收尾計畫，目前就等行政院長賴清德拍板宣布，也避免海生館爛尾樓衝擊明年底基隆市的選情。
據本刊掌握權威消息，行政院幾乎已拍板確定，將採第二方案，由政府收回自建，朝「公共建設」的方向來規劃，只是明年度的預算已經來不及編列，最快也要2019年才有可能再編預算重新動工，落成日期也要到2021年，而且不考慮買下慶陽的原始設計圖，將全部敲掉重蓋，避免後續與慶陽衍生合約糾紛。
會採政府自建再委外經營模式，主要是教育部內部評估，「BOT＋OT」的可行性相當低，如果再遇到慶陽這樣的廠商，恐怕未來十年都很難看到海生館落成啟用，因此要求海科館盡快完成海生館後續評估報告。
海科館內部人士透露，2005年行政院核定海科館採取「促進民間參與公共建設」模式，如今突然要改為政府自建再委外，恐怕難以自圓其說，全案也要再要送國發會審議，如果沒有好的理由，仍然可能被打回票。
不過，如要找其他廠商接手BOT案難度恐怕更高。知情人士透露，海科館確定與慶陽解約後，曾私下詢問負責屏東海生館經營的南仁湖集團有無意願承接，但南仁湖以大環境不佳，連屏東海生館人潮都不若以往，拒絕再投標。其他有相關經驗的廠商也興趣缺缺，主辦聯貸的土地銀行更多次打探相關業者意願，得到的答案同樣是否定的，這才迫使土銀正式函覆海科館「不行使融資介入權」。
