孫宇凡在臉書上指出，《工作指引》存在對陸生的歧視性差異對待，預期會嚴重影響陸生在台就學的合法合理權益，所以致信向中央流行疫情指揮中心、衛生福利部、教育部抗議。
孫宇凡說，該《工作指引》嚴重影響陸生入學、學籍以及精神健康，並且對於被要求「集中監測管理14天」與其他自主管理差別待遇表達嚴重不滿。孫宇凡要求教育部公開道歉，還要求教育部對學費、學分費等所有陸生繳納費用按計日的比例進行免除，對學籍與課業予以對應支持。
除此之外，孫宇凡向中央流行疫情指揮中心、衛生福利部、教育部要求，對隔離期間未確診新型冠狀病毒肺炎的陸生予以賠償。必要時，若在隔離期間確診該肺炎的陸生，可依和台灣學生同等的全民健康保險標準予以醫治。
不過這樣的說法，引發台灣網友不滿，認為台灣並未虧欠陸生什麼，且武漢肺炎病毒為中國傳來，還要讓陸生享用與台灣全民健康保險標準予以醫治，似乎有點說不過去。
PTT上則有網友舉例，南韓政府為因應陸生及防疫問題，釜山大學已考慮要讓陸生自行休學。並且反嗆孫宇凡沒要求中國政府和中國人向台灣道歉、賠償因為瘟疫造成的經濟損失或因恐慌造成的心理創傷，已經很夠意思了。
