截至27日為止，駐沖繩美軍共239人感染，比沖繩全境還多。沖繩從5月份68天的零感染，到7月底疫情卻開始爆增，28日新增21人確診，連續2天創新高，累計231人感染，縣內警戒層級也拉高到「流行警戒期」。
據了解，美軍不需要護照、不需經海關檢疫，就能入境日本，加上7、8月美軍正進行大規模人事異動，因此用一般客機把人員和眷屬往沖繩送，讓當地民眾擔憂疫情再度失控。目前沖繩島中部的美國海軍陸戰隊基地，已爆發群聚感染，至少有84人確診。
事實上，美軍在沖繩約2萬5千人，不過飛抵駐日基地的軍人，不用接受日本海關檢疫，在日本抗議下，美軍才決定，所有入境的相關人士必須隔離兩週且接受篩檢。據美方公布的數據，駐日美軍基地確診者，約9成都在沖繩。
除了美軍爆發群聚感染外，沖繩縣觀光也面臨問題，政府一度考慮，要求縣外旅客避免來沖繩，但在經濟考量下，只能暫時作罷，因為沖繩仰賴觀光為經濟命脈。
