霧峰林家長房子孫林義功指出，921大地震後，家族所有，被認定為國家級的古蹟被震倒、毀壞不少，台中市政府文化局、中央的文建會（文化部前身）前後撥款共11億元修繕，在「三位一體」的邏輯下，也是由林正方父子的「林本堂股份有限公司」出面接受政府的補助款，甚至就連林家「宮保第」等古蹟景點的門票、商店的收入，也都進入了這家私人公司。
林義功兄弟指出，或許因為心虛，林正方父子急於讓「林本堂股份有限公司」漂白，以獲得支配祖產的法律地位，所以他們接連提出3件行政訴訟，結果卻適得其反，通通獲判敗訴。
最早的一起官司，是2014年，台中縣市合併後，林正方要求市府核發證明文件，確認「林本堂股份有限公司」等同「林本堂產業株式會社」，遭市府拒絕，因此轉向法院提起行政訴訟，結果也敗訴。
緊接著，2016年，林正方父子乾脆要求台中大里地政事務所，將登記在「林本堂產業株式會社」名下的土地，直接改登記在他們的公司，被拒絕後，一樣打行政訴訟，還是一路敗到底。
最後，因921大地震後，文建會把修繕經費撥給台中市政府，再由市府撥給林正方父子的公司，但文化部成立後，發現林家產權不清，拒絕撥款，於是林正方父子再打行政訴訟，要求文化部依慣例撥款，也希望藉此官司證明他們是林家代表，但仍敗訴。文化部明白表示，只撥款給「林本堂產業株式會社」，該公司無法代表。
「霧峰林家林祖密將軍紀念協進會」法務秘書劉麗萍指出，這三場官司打破了三位一體的鬼話，也證實林本堂株式會社（即祭祀公業）是「非法人團體」，屬《民法》上的「合夥組織」，資產應該是全體繼承人「公同共有」。
林義功兄弟則表示，官司讓他們看到重新恢復祭祀公業的希望，他們準備提出民事訴訟，先解任株式會社的主委林正方、重選管理人，也不排除控告林正方父子背信、詐欺、侵占，希望透過法律途徑，討回屬於全體子孫共有的財產。
