馬英九今（11日）在臉書表示，「我們也許對很多事情看法不同，對政策乃至國家挑戰的解方，我們也許意見不見得一致。」不過馬英九認為，誠信、正派應該是從政者一致的標準。
針對林智堅論文案一事馬英九發表自身看法，他說事件經台灣大學嚴謹審定程序做出評斷，並撤銷林智堅碩士學位後，「道理已經很清楚。」馬英九說他也看到許多色彩不同，甚至政治立場南轅北轍的政治人物、學者們，都一致認為，台灣大學的決定維護了學術最基本的尊嚴，也維護台大百年校譽。
馬英九說，很遺憾看到掌握權力的人，卻因為選舉的考量，為了維護權力與私利，選擇不相信台灣大學，也拒絕挺台灣大學。身為前總統，同時又是台大校友，馬英九表態支持母校，「更要挺台大的決定，我以台大為榮。」
