高雄市長陳其邁責請衛生局、教育局、社會局展開聯合稽查，說明市府「以藥追人」，共清查全市2,702家醫院、診所、藥局，發現共145家持有苯巴比妥，其中情節較嚴重的是4名醫師有不當用藥情形（使用苯巴比妥）。
高雄市同步啟動「護童專案」，今起會主動通知近1個月，有在該4間診所使用苯巴比妥，或近半年內在4間診所使用苯巴比妥3次以上、未滿18歲的孩童及家長，可至高醫、榮總、高長、義大（大昌）4家醫學中心接受免費醫療評估及看診，衛生局並開設專線（07）7230250提供市民朋友諮詢服務。
新北市發生幼兒園使用苯巴比妥引起各界關注，高市府衛生局在新北市案件爆發後，6月8日即透過管制藥品系統，調閱全市醫療院所和藥局苯巴比妥用藥情形。經清查145家持有苯巴比妥的醫院、診所和藥局，查察醫生開立處方及藥物流向。根據苯巴比妥用藥臨床指引及兒科專家審議，包括感冒與其他急性呼吸道感染，不應使用苯巴比妥，市府查到4名醫師不當使用。
市府衛生局表示，經蒐集違規事證並約談涉案醫師，並在11日、13日和16日，邀集高醫、榮總、義大、高雄長庚等四大醫學中心小兒醫學部主任，及毒物、藥學專家等，召開苯巴比妥不當處方專家會議。專家討論後決議，該4名醫師涉嫌違反《醫師法》及《管制藥品管理條例》，故衛生局於16日發函這4名醫師，勒令停業1到6個月，並對4名醫師分別處以11萬至33萬元不等罰鍰。
