卓榮泰日前飛往日本觀看WBC比賽，成為台日斷交以來首位在任內訪問日本的行政院長，此消息曝光引起許多討論。中國方面則不滿日本，竟讓台灣行政院長入境訪問，日方則與卓揆都發聲回應，該趟行程是私人行程。
卓榮泰昨於臉書po文談及此事，強調這趟看球「是休假 自費 私人行程。」不過國民黨立委王鴻薇等人依舊提出質疑，「卓榮泰包機看球誰買單？私人行程用松指部有特權？」並提到卓院長就算自費也是有特權疑慮，松指部是軍用機場，「官員私人行程可以任意使用嗎？」若不是自費又非公務行程，「那恐怕是涉及上百萬的個人貪瀆問題了。」
對此，行政院發言人李慧芝下午回應，卓院長與民眾一樣，都非常關心這次WBC國家代表隊狀況。她重申強調，院長已公開說明，此次行程為私人行程，且皆為自費，包括維安隨行人員的機票也是由院長支付，行政院及相關部會或事業單位都沒有支出任何費用。且出國前皆依規定向行政院提出申請，一切依規定辦理。
