馬英九說：「很遺憾檢察官偵察的階段，並沒有了解我對這件事的說明。這件事發生時，黃總長來向我報告，因為涉及到高層立委，也涉及相關部會，一旦曝光將是世界級的醜聞，所以我基於2個原因要請行政院長及總統府幕僚來我家共商因應之道。
第一個原因是，這將會影響到行政院與立法院未來的關係，也可能影響到行政院送法案的進度，因此必需要請江宜樺院長來官邸一趟；第二個原因是，涉及到部會首長，將來若有政治責任，很可能會有異動發生，首長任命是行政院長與總統共同權責，這也是憲法56條所規定，行政院副院長及各部會首長，由院長提請總統任命，所以部會首長去留是院長與總統共享的權力。」
馬英九進一步說明，在這樣的情況下，找行政院長及秘書長羅智強做危機處理，一旦曝光後要怎麼因應，這是一般公務處理過程，不涉及犯罪，尤其是這2位都不是不應該知道的人。在這種情況下，馬英九將會在法庭上詳細說明「公務處理不涉及犯罪」，馬強調：「我對我的清白有信心，也希望法院真正秉持公平正義做出正確判決。」
