三中案交易進行時,中投公司曾對中視交易案祕密開會討論,馬英九擔心破局,下達協商指令後離席,張哲琛直接了當地表示:「他(余建新)」就壓英九啊」,詹春柏也表示:「你(張哲琛)在bargain的時候,你就處於弱勢嘛」,蔡正元則接話稱:「他(余建新)就吃定你(指馬英九)說,你想選總統嘛。」
由於余建新和國民黨在協商時,曾怒嗆馬英九「你以為選得上總統嗎?」後來馬英九態度鬆動,整起交易案確定回饋余建新4.8億元。
2016年3月,國民黨正值黨主席補選期間,蔡正元在臉書又提到中影案回算分潤機制,並且指控這些錢究竟跑哪去,只有黨主席知道,等於公開質疑馬英九全知情,而回算機制也是中影交易案最可疑之處,暗藏諸多可以動手腳的地方。
蔡正元被收押時,向檢方反咬恐有國民黨高層涉案,質疑中投公司當年給時任黨主席馬英九的黨產機密報告造假,中影三大不動產出現鉅額價差,交易後害國民黨短收50億元。
檢方取得中投公司在2010年4月2日完成的《真相-中影股權交易案始末》內部調查報告,內容多達40頁,封面還加註「機密報告」,詳述中影案緣起、蔡正元扮演角色及鴻海集團創辦人郭台銘胞弟、正崴精密董事長郭台強取得中影經營權的過程,循線比對金流去向。