最高法院2016年，依貪汙罪將何智輝判刑13年定讞，此時竟發現，全案的證物竟不見了，清查之後發現，早在 2013年，證物就已不見，當時最高法院將全案卷證轉送台北地檢署，待其執行相關後續程序，轉送的卷證包含所有犯罪證物等正本，理應入庫保存。
北檢認為，卷證不全，先要求法院補足後再一併簽收，但因為還沒正式點交，北檢竟將全案的證據任意放在贓證物庫的大廳地板上，沒想到，隔天北檢適逢安排銷毀贓物，載運的工人把待銷毀的贓物一箱一箱搬上車，連放在大廳地板上的何智輝犯罪證物也一起搬上車，裝運齊全後，直接運往木柵焚化廠銷毀。
事後，法院補足缺漏的證物時，北檢卻遍尋不著何智輝的犯罪卷證，讓負責的檢察官急得像熱鍋上的螞蟻，氣得直跳腳，北檢只好大動作清查，過濾數十個監視器，才發現工人把何智輝的證物搬上車，運往木柵焚化爐一把火燒個精光，整個離奇過程，從監視畫面上看得一清二楚，卻已無可挽救。
