由和碩董座童子賢帶動，引發社會熱烈討論的能源政策、配比，也與淨零排放息息相關。雖然能源政策非環境部管轄，但事涉零碳排，彭啓明也提出看法，「淨零路徑能否達成與電力排碳係數攸關，發電排碳係數如能降低，對企業造成的減碳壓力也會變小，目前最有效方法仍是再生能源。」
彭啓明補充說，能源的主管機關為經濟部能源署，但在推動綠色再生能源上，如何在太陽能、風力發電建置的同時，還能維持生態環境的平衡，就成為環境部負責範疇，像提出保護山坡地、濕地或重要的國有地不要被破壞的標準，拿捏環境保護和能源建置的尺度。
此外，環境部也放寬部分要求，像是實驗性質的地熱發電免環評，鼓勵企業參與；適度開放部分小水力建置，增加再生能源的發展空間。但針對濕地或是重要的特種林地，或整個林區開發會有一定限制，這也是環境部對台灣環境保護的堅持。
對於核三廠一號機除役，國內基載電力是否足夠，成為各界關注焦點。「首先、核廢料必須妥善處理；再者，核能必須取得台灣社會共識。」彭啓明表明對核電的看法，「未來的能源有多種可能性，不管是核能、氫能、地熱，或是用新型的碳捕捉與封存（CCS）技術搭配天然氣發電，都是選項，不應排除任何可能。」
但彭啓明也強調，第28屆聯合國氣候變遷大會（COP28）最重要結論就是再生能源要比2022年再多2倍以上。核能並非唯一解方，成本高低與民眾可接受性都須納入考量，「不要糾葛於某種能源，而是要從眾多能源中，選擇對台灣戰略上有意義的技術。」
話鋒一轉，彭啓明笑說：「氣候變遷像是頭大象，就像瞎子摸象一樣，近距離摸到尾巴就覺得是這樣，若不把眼光拉遠，難以讓各界瞭解實際狀況，也難以共同解決氣候變遷的種種問題。」
面對2050年淨零排放目標，彭啓明坦言，台灣尚處小學生階段，未必能在2050年實現，全世界也都可能如此。因此在他任內，很難保證能降低多少碳排比例，他最重要的目標是讓台灣因應氣候變遷的動能，與國際銜接更緊密，讓大家共識更靠齊，除碳費外，推出更多有利淨零排放的政策。
