本刊取得多段內部會議的錄音檔，陳素芬來在內部會議上，經常以高分貝咆哮的方式交辦工作事項，不少科員皆遭受過她的辱罵，但是都隱忍未發，直到近日，有科員出現嚴重的身心疾病，引起內部議論紛紛，整起事件才曝光。
根據錄音檔內容，陳素芬曾在工作會議中，高分貝斥責申請休假的員工：「你在博物館工作，又不是在一般的機構做，你在博物館工作，它就有淡旺季，就這麼明顯，啊不然怎樣？」還搬出教育部說，部會都宣導應該在暑假、立法院開議前出國，在旺季就不該請假，「3月底才剛回來，然後你5月初又要再去，啊不然是怎樣？那你就不要回來了啊！你就乾脆就退休算了！那是不是時間更多！」最後直接裁定，「這個事情再講啦！我暫時不同意！」否決員工的休假申請。
爆料人士指出，陳素芬2019年接任海科館長以來，經常把績效列為首位，但陳對員工管理卻經常夾帶個人情緒，讓底下主管長期處於她的精神壓力下工作，有些當初在創館時喜歡海科館環境的公務體系員工，更寧願請調其他單位，「明明在這麼歡樂健康的博物館上班，職場人際從屬卻是有毒的！」
對於被指控霸凌，本刊致電詢問陳素芬回應，她表示，這當然不是霸凌，只是口氣有點嚴厲，但那是堅定而非在指責同仁，她的哲學是大家都是一個Team，關起門來就應該「敞開心胸」討論事情，否則就是鄉愿。她也強調，博物館工作是為了服務民眾，要站在民眾角度思考，海科館內大部分是研究員，在顧客關係或心理這方面比較薄弱，所以她花不少心力與大家溝通，是盼能做到顧客至上。
至於有員工請假未獲准，她認為，博物館員工都是領納稅人的錢，雖然每個人有自己的權利，法律也有明定，但這是一項公共服務事業，當然要考慮淡旺季問題排休，所以希望同仁能調整一下，「不應該如此嗎？」「你不能只想到你自己，只要我喜歡有什麼不可以」，若她的言詞被覺得是霸凌同仁的話，她嘆：「現在的主管很難當喔！」
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