司改國是會議於4月24日的分組會議中決議，負責終審個案的最高法院法官由現有74位減為14位，司法院長提3倍人選，經遴選小組刪去3分之1後，再讓總統從28人中圈選出14位出任，經媒體報導各界質疑這是政治干預司法，若加上司改國是會第四分組將討要將檢察官司法屬性改為行政官，有法官與檢察官更是質疑總統想藉此以政治力掌控整個司法體系。
對於外界質疑總統在最高法院任命新制中擴權，司法院決定對分組決議提出修正意見，希望從遴選委員的多元性加強，選任的過程，原本是總統可以從人選中2選1任命，修改為以具備多元民主性組成遴選委員會，由司法院長提出應任名額2倍人選，由遴選委員會選出應任人選，最後由總統任命，總統無實質選任權，僅有形式上的任命權。
今由高等法院法官林孟皇與東吳大學政治系副教授陳俊宏提出的最終審法官任命修正案，法官張升星則認為應該可維持原決議，因為總統任命最高法院法官後，不見得就能控制最高法院法官，張升星說，日前美國總統川普為「通俄門」調查，表示對他所任用的司法部長塞辛斯非常失望，這正可證明，總統實質任命最最高法院法官，不一定能控制法官，就像男生追求女生時，牽手送花、親嘴說會做家事，但被「任命」為配偶後，沒送花但是很花，不親嘴只會頂嘴，不做家事只會看電視。
蔡英文在聽完林孟皇與陳俊宏報告說明後說：「我的看法通過第一案，如果大家可以接受，過第一案」，有委員立即說：「原案推翻嗎？」蔡英文笑著回應：「對對對，我被推翻了，不用不好意思」，後來表決，讚成票只有44票，蔡英立即說，你們在搞什麼啊！另針對第2案表決，只有25票，蔡英文反問，你們打算怎麼辦？最後進行第3及第4次表決，針對是否修正最高法院任命案進行投票，以66票通過修正，總統對最高法院法官僅有形式任命權。
蔡英文開心地說：「這不是我第一次要你們表決的嗎！繞了一大圈，好啦！這案子可以過了啦，66票就通過吧！」
