台北地院發言人黃柄縉庭長表示，此案檢察官起訴狀所指被告所涉犯證券交易法的相關規定，屬於台北地院刑事金融法庭受理的案件，且檢察官起訴認定三中案造成國民黨黨營事業損害超過1億元，所以台北地院以「金重訴」案件處理。
抽籤前黃柄縉庭長指出，台北地院金融庭的配置由刑事第16庭至刑事第19庭共4庭。其中刑事第16庭理股鄭昱仁法官於今年8月29日將調動至司法院行政廳辦事，此部分日前已由司法院人事審議委員會審議通過遷調案，另外刑事第16庭實股高若珊法官因為生涯規劃關係，將於8月29日辭職，因此如果中籤為理股或實股時，將來承審法官會有異動。
後來經由另名庭長葉力旗，在媒體見證下，從籤箱中抽出「理」股，也就是由即將調職的鄭昱仁法官承審，依配置，此案將由刑16庭審判長胡宗淦、受命法官鄭昱仁、及陪席法官高若珊合議審理，黃柄縉庭長指出，由於受命法官將調職，陪席法官將辭職，承審合議庭的成員到8月29日後將會有所變動，3位法官將有2位更換。
台北地檢署起訴前總統馬英九等人，整份起訴書共達762頁，檢方認定，對國民黨於早期特殊時空背景下持有大量財產，且部分存有極高爭議，馬英九處於歷史轉折點，理應發揮善良管理人注意義務，竟惑於權位、密室暗議，私相授受財產，造成國民黨及華夏等公司股東損失，且犯後態度不佳，起訴後建請法院從重量刑。
