9月20日，橋頭地檢署指揮刑事局、憲兵、食藥署和新北、彰化、高雄等衛生局，三向同步搜索義進金公司及其彰化、高雄分公司，帶回負責人蘇文源兄妹和親戚等6人；蘇男等人對於回收即期蛋品改標一事，供詞莫衷一是，全案依《刑法》和《食品安全衛生管理法》偵辦，檢方訊後諭令2萬至50萬元交保。
蘇嫌等人都向檢察官坦承，為了減少銷毀的損失，並配合超市要求促銷品，確實將7月分被檢出乃卡巴精殘藥的蛋品回收、改標，再重新換裝上市販售。蘇文源接受本刊電訪時也坦承，確實把出包的家和牧場改為輝煌牧場，對此「疏忽」相當懊悔。
犯嫌都向檢方招認了，反而是中央和地方仍忙著撇清責任，嘉義縣政府聲稱，該案是在7月16日於朴子全聯驗出乃卡巴精，因涉案蛋品有產銷履歷認證，嘉縣展開輔導，後來農委會表示該「複驗」通過評核，9月16日重新上架。
彰化縣動檢所卻直到8月3日接獲農委會通報，立刻進行牧場移動管制，8月6日採集蛋品送驗，9日檢驗報告出爐沒有乃卡巴精殘留；但農委會通報個案和動檢所送檢的蛋品就不同批，根本不是「複驗」，動檢所只能針對前述「既成事實」個案，處罰3至15萬元。
農委會也發布新聞說，嘉義縣政府受託抽驗市售具產銷履歷驗證家禽產品，9月15日農委會獲知業者的蛋品有不得檢出的動物用藥，即要求彰化動檢所和認證單位管制移動、抽驗和撤銷履歷認證資格。還辯稱是彰化縣方面通過「複驗」，家和牧場才恢復驗證資格。
中央到地相關單位說明的都是形式上公文流程，實質的食安把關卻置之不理，更別提消費者買回家的「問題蛋品」；農產品出了狀況，衛生單位也一副事不關己，全然把民眾的食安置之度外，網路一片罵聲，「怠惰跟裝沒事的公務員一樣有罪」「當官的心態很可惡」。
