中研院進一步解釋，國際學術界的重要獎項，包括沃爾夫獎（The Wolf Prize）、日本獎（The Japan Prize）、京都獎（The Kyoto Prize）等，均有獨立的評選制度。當初唐獎草創之際，由中研院協助辦理評選工作，第一、二屆舉辦下來，頗受好評，顯示基金會運作日漸成熟穩定。中研院強調，雖然不承辦評選工作，但中研院院長廖俊智鼓勵院士及非院士的研究人員以個人身分參與，並樂見其成。
至於退回唐獎捐助經費，中研院說明，已經退回106年的委任費用1千萬元以及辦公室租金，至於107年的1千萬元雖然尚未收到，但也通知唐獎基金會不用再支付這筆費用當成中研院研究費。
