據《讀賣新聞》報導，日本對台窗口「日本台灣交流協會」與台灣在日窗口「台灣日本關係協會」，去年12月18日簽署了《出入境管制相關事項資訊共享合作備忘錄》；日台交流協會聲明表示內容為不公開。
不過消息人士指出，這份合作協議是在台灣發生緊急事態時，日本將收到從台灣入境的外籍人士資訊，以在緊急情況下篩選可能造成負面影響的人員；就算是和平時期，台灣也會在機場就先對前往日本的旅客進行預先篩選。
日本官員透露，日台當局針對台灣緊急狀態簽署備忘錄的情況相當少見，有關員警惕表示：「中國間諜可能偽裝成台灣人進入日本」。
對此，外交部發言人蕭光偉上午在記者會上被問及此事時表示，台灣與日本國民情感友好深厚，人員互動頻密，去年兩國人民互訪已逾732萬人次，因此雙方在入出境管理的合作更顯重要。外交部樂見台日雙方就入出境管理事務持續深化、相互合作，建立更緊密的夥伴關係。
據報，移民署官網顯示，移民署已於2024年12月18日與日本簽署入出境管理事務資訊共享合作備忘錄。
