檢方起訴指出，陳瑞堂負責該場廚餘蒸煮申報作業，本應依實際蒸煮情形逐日申報，詎為規避環保機關查核及告發，先於2022年間預先拍攝蒸煮照片存於手機，復自2023年1月8日起至9月30日止，於每日申報時反覆上傳舊照片充作當日蒸煮證明。另又因標購廚餘數量逾實際使用量，竟違反契約約定，將部分廚餘轉售予他場，並明知該等廚餘未於場內再利用，且未實際使用所申報之燃料數量，仍於去年1月至9月間，委由不詳業者代為申報不實資訊，損害主管機關對相關資訊管理的正確性。
從去年10月10日起，該畜牧場豬隻陸續大量死亡，陳姓父子未通報疫病，僅自行以抗生素投藥處理，仍無法遏止死亡情形。2人為避免疫情外洩，影響拍賣銷售，竟謀議僅將部分死亡豬隻交由合法化製業者處理，其餘則委由不詳非法業者清除，以降低申報死亡數量。自同年10月10日至日至20日止，由陳瑞堂每日統計實際死亡頭數，陳福委託化製三聯單填載不實數量後，交付運輸司機載運。經比對動保防疫機關訪視紀錄與三聯單記載內容，短少申報死亡豬隻共46頭，並已將該等豬隻交由非法業者清除處理。
臺中市動物保護防疫處兩度訪視並記載各日死亡頭數，因持續異常死亡而強制採樣送驗，最終確認最終確認感染非洲豬瘟並於去年10月22日依規定預防性撲殺場內尚存活豬隻195頭。
全案於去年10月22日傳出中市梧棲區某養豬場經農業主管機關檢出非洲豬瘟核酸陽性反應後，中檢偵辦，檢察官認為2人犯罪動機僅為降低成本、規避責任，罔顧公共利益及產業安全，且於偵查中未坦承犯行，致防疫追蹤作業受阻，惡性重大，建請法官求處重刑。
